维康桑格研究所使用NVIDIA加速计算加速癌症研究,同时实现拯救生命与节能

原创 英伟达NVIDIA中国 2024-10-28 17:20

总部位于英国的维康桑格研究所的 DNA 测序实验室每年分析数以万计的基因组,为癌症的形成和治疗效果提供洞察。


*主图由维康桑格研究所提供


维康桑格研究所是国际人类基因组计划的重要贡献者,该研究所正在使用 NVIDIA 加速计算技术来节省能源,同时挽救生命。


作为全球最大的基因测序机构之一,这家位于英国的研究所已读取了超过 48 个 Petabase(或 48 千万亿个碱基对)的 DNA 和 RNA 序列,以提炼有关健康和疾病的关键洞察。


为了研究引发癌症形成的突变过程以及决定治疗效果的基因变异,该研究所的癌症、衰老和体细胞突变(CASM)项目每年对数万个癌症基因组进行测序和分析。


为了如此大规模研究的顺利进行,维康桑格研究所正在尝试使用具备 NVIDIA Parabricks 的 NVIDIA 系统。NVIDIA Parabricks 是一个可扩展的基因组学分析软件套件,它利用加速计算,将数据处理时间缩短至几分钟。


维康桑格研究所 CASM 主要软件开发人员 Jingwei Wang 表示:“维康桑格研究所每年要处理数十万份体细胞样本。NVIDIA 加速计算和 Parabricks 将为我们的样本分析工作节省大量时间、成本和能源。我们十分高兴能够借助 NVIDIA Grace、Grace Hopper 等 NVIDIA 的先进架构来提高性能和效率。”


减少运行时间和能耗


维康桑格研究所致力于开发高通量癌症样本模型,这些模型可用于全基因组功能筛选和药物测试。


NVIDIA 加速计算和软件大大减少了该研究所每个基因组的分析运行时间和能耗。


为了使用 Burrows-Wheeler Aligner(BWA,一个用于根据大型参考基因组绘制 DNA 序列的软件包)加速基因组分析,维康桑格研究所使用了其在 CPU 上运行的自主工作流 CaVEMan,并且正在尝试利用 NVIDIA GPU 上的 Parabricks。


该研究所使用一个 NVIDIA 系统,和使用 128 台双路 CPU 服务器时相比,就将运行时间缩短 37.5%,成本和能耗也将分别减少 96% 和 98%。


该研究所每年每测序 1 万个基因组,就要消耗约 1.25 亿个 CPU 小时。


这意味着,维康桑格研究所如果改为通过 GPU 上的 Parabricks 使用 BWA,每年可节省 100 万美元和 1000 兆瓦时的电,这相当于一个美国普通家庭 100 年的用电量。


与行业领先者合作


维康桑格研究所的 NVIDIA 加速测序实验室可谓是一个 AI 工厂。只要给它输入数据,就能生产出智能。


AI 工厂是拥有先进全栈加速计算平台的下一代数据中心,可执行最密集的计算任务。


在研究对于发现新癌症基因和突变过程至关重要的科学问题时,维康桑格研究所正在通过将 NVIDIA 基础设施用于其 AI 工厂,来提高运营和能源效率。


另外,建造 AI 工厂的企业和组织正在与能源管理和自动化公司施耐德电气等领先企业开展跨行业合作,通过优化数据中心的设计,以最节能的方式运行苛刻的工作负载。


维康桑格研究所正在与施耐德电气一起,尽可能减少数据中心的停机时间,同时为 DNA 测序实验室的数据中心配备不间断电源和冷却设备,以及其他关键的节能技术。


在今年 3 月举行的 NVIDIA GTC 大会上,施耐德电气宣布将发布专为 NVIDIA 加速计算集群定制的 AI 数据中心参考设计,以帮助各个行业的企业机构优化基础设施。


这些参考设计专门用于数据处理、工程仿真、电子设计自动化、计算机辅助药物设计和生成式 AI,将侧重于可扩展、可持续、高性能数据中心的大功率配电、液冷系统等方面。


在由《经济学人》杂志主办的纽约气候周专题讨论会上,来自维康桑格研究所、施耐德电气和 NVIDIA 的代表将介绍他们的工作。


进一步了解有关可持续计算威康桑格研究所可能挽救生命的工作


  • https://www.nvidia.cn/data-center/sustainable-computing/


  • https://resources.nvidia.com/en-us-energy-efficiency/gen-ai-for-finding-cancer-faster?ncid=prsy-503733-vt12



点击“阅读原文”,或扫描下方海报二维码,观看 NVIDIA 创始人兼首席执行官黄仁勋与信实工业董事长穆克什·安巴尼在 NVIDIA AI Summit India 上就 AI 未来进行的炉边谈话回放。


评论
  • 日前,商务部等部门办公厅印发《手机、平板、智能手表(手环)购新补贴实施方案》明确,个人消费者购买手机、平板、智能手表(手环)3类数码产品(单件销售价格不超过6000元),可享受购新补贴。每人每类可补贴1件,每件补贴比例为减去生产、流通环节及移动运营商所有优惠后最终销售价格的15%,每件最高不超过500元。目前,京东已经做好了承接手机、平板等数码产品国补优惠的落地准备工作,未来随着各省市关于手机、平板等品类的国补开启,京东将第一时间率先上线,满足消费者的换新升级需求。为保障国补的真实有效发放,基于
    华尔街科技眼 2025-01-17 10:44 221浏览
  • Ubuntu20.04默认情况下为root账号自动登录,本文介绍如何取消root账号自动登录,改为通过输入账号密码登录,使用触觉智能EVB3568鸿蒙开发板演示,搭载瑞芯微RK3568,四核A55处理器,主频2.0Ghz,1T算力NPU;支持OpenHarmony5.0及Linux、Android等操作系统,接口丰富,开发评估快人一步!添加新账号1、使用adduser命令来添加新用户,用户名以industio为例,系统会提示设置密码以及其他信息,您可以根据需要填写或跳过,命令如下:root@id
    Industio_触觉智能 2025-01-17 14:14 121浏览
  • 临近春节,各方社交及应酬也变得多起来了,甚至一月份就排满了各式约见。有的是关系好的专业朋友的周末“恳谈会”,基本是关于2025年经济预判的话题,以及如何稳定工作等话题;但更多的预约是来自几个客户老板及副总裁们的见面,他们为今年的经济预判与企业发展焦虑而来。在聊天过程中,我发现今年的聊天有个很有意思的“点”,挺多人尤其关心我到底是怎么成长成现在的多领域风格的,还能掌握一些经济趋势的分析能力,到底学过哪些专业、在企业管过哪些具体事情?单单就这个一个月内,我就重复了数次“为什么”,再辅以我上次写的:《
    牛言喵语 2025-01-22 17:10 41浏览
  • 高速先生成员--黄刚这不马上就要过年了嘛,高速先生就不打算给大家上难度了,整一篇简单但很实用的文章给大伙瞧瞧好了。相信这个标题一出来,尤其对于PCB设计工程师来说,心就立马凉了半截。他们辛辛苦苦进行PCB的过孔设计,高速先生居然说设计多大的过孔他们不关心!另外估计这时候就跳出很多“挑刺”的粉丝了哈,因为翻看很多以往的文章,高速先生都表达了过孔孔径对高速性能的影响是很大的哦!咋滴,今天居然说孔径不关心了?别,别急哈,听高速先生在这篇文章中娓娓道来。首先还是要对各位设计工程师的设计表示肯定,毕竟像我
    一博科技 2025-01-21 16:17 100浏览
  •  光伏及击穿,都可视之为 复合的逆过程,但是,复合、光伏与击穿,不单是进程的方向相反,偏置状态也不一样,复合的工况,是正偏,光伏是零偏,击穿与漂移则是反偏,光伏的能源是外来的,而击穿消耗的是结区自身和电源的能量,漂移的载流子是 客席载流子,须借外延层才能引入,客席载流子 不受反偏PN结的空乏区阻碍,能漂不能漂,只取决于反偏PN结是否处于外延层的「射程」范围,而穿通的成因,则是因耗尽层的过度扩张,致使跟 端子、外延层或其他空乏区 碰触,当耗尽层融通,耐压 (反向阻断能力) 即告彻底丧失,
    MrCU204 2025-01-17 11:30 182浏览
  •  万万没想到!科幻电影中的人形机器人,正在一步步走进我们人类的日常生活中来了。1月17日,乐聚将第100台全尺寸人形机器人交付北汽越野车,再次吹响了人形机器人疯狂进厂打工的号角。无独有尔,银河通用机器人作为一家成立不到两年时间的创业公司,在短短一年多时间内推出革命性的第一代产品Galbot G1,这是一款轮式、双臂、身体可折叠的人形机器人,得到了美团战投、经纬创投、IDG资本等众多投资方的认可。作为一家成立仅仅只有两年多时间的企业,智元机器人也把机器人从梦想带进了现实。2024年8月1
    刘旷 2025-01-21 11:15 390浏览
  • 数字隔离芯片是一种实现电气隔离功能的集成电路,在工业自动化、汽车电子、光伏储能与电力通信等领域的电气系统中发挥着至关重要的作用。其不仅可令高、低压系统之间相互独立,提高低压系统的抗干扰能力,同时还可确保高、低压系统之间的安全交互,使系统稳定工作,并避免操作者遭受来自高压系统的电击伤害。典型数字隔离芯片的简化原理图值得一提的是,数字隔离芯片历经多年发展,其应用范围已十分广泛,凡涉及到在高、低压系统之间进行信号传输的场景中基本都需要应用到此种芯片。那么,电气工程师在进行电路设计时到底该如何评估选择一
    华普微HOPERF 2025-01-20 16:50 73浏览
  • 本文介绍瑞芯微开发板/主板Android配置APK默认开启性能模式方法,开启性能模式后,APK的CPU使用优先级会有所提高。触觉智能RK3562开发板演示,搭载4核A53处理器,主频高达2.0GHz;内置独立1Tops算力NPU,可应用于物联网网关、平板电脑、智能家居、教育电子、工业显示与控制等行业。源码修改修改源码根目录下文件device/rockchip/rk3562/package_performance.xml并添加以下内容,注意"+"号为添加内容,"com.tencent.mm"为AP
    Industio_触觉智能 2025-01-17 14:09 164浏览
  •     IPC-2581是基于ODB++标准、结合PCB行业特点而指定的PCB加工文件规范。    IPC-2581旨在替代CAM350格式,成为PCB加工行业的新的工业规范。    有一些免费软件,可以查看(不可修改)IPC-2581数据文件。这些软件典型用途是工艺校核。    1. Vu2581        出品:Downstream     
    电子知识打边炉 2025-01-22 11:12 49浏览
  • 嘿,咱来聊聊RISC-V MCU技术哈。 这RISC-V MCU技术呢,简单来说就是基于一个叫RISC-V的指令集架构做出的微控制器技术。RISC-V这个啊,2010年的时候,是加州大学伯克利分校的研究团队弄出来的,目的就是想搞个新的、开放的指令集架构,能跟上现代计算的需要。到了2015年,专门成立了个RISC-V基金会,让这个架构更标准,也更好地推广开了。这几年啊,这个RISC-V的生态系统发展得可快了,好多公司和机构都加入了RISC-V International,还推出了不少RISC-V
    丙丁先生 2025-01-21 12:10 111浏览
  • 现在为止,我们已经完成了Purple Pi OH主板的串口调试和部分配件的连接,接下来,让我们趁热打铁,完成剩余配件的连接!注:配件连接前请断开主板所有供电,避免敏感电路损坏!1.1 耳机接口主板有一路OTMP 标准四节耳机座J6,具备进行音频输出及录音功能,接入耳机后声音将优先从耳机输出,如下图所示:1.21.2 相机接口MIPI CSI 接口如上图所示,支持OV5648 和OV8858 摄像头模组。接入摄像头模组后,使用系统相机软件打开相机拍照和录像,如下图所示:1.3 以太网接口主板有一路
    Industio_触觉智能 2025-01-20 11:04 150浏览
  • 2024年是很平淡的一年,能保住饭碗就是万幸了,公司业绩不好,跳槽又不敢跳,还有一个原因就是老板对我们这些员工还是很好的,碍于人情也不能在公司困难时去雪上加霜。在工作其间遇到的大问题没有,小问题还是有不少,这里就举一两个来说一下。第一个就是,先看下下面的这个封装,你能猜出它的引脚间距是多少吗?这种排线座比较常规的是0.6mm间距(即排线是0.3mm间距)的,而这个规格也是我们用得最多的,所以我们按惯性思维来看的话,就会认为这个座子就是0.6mm间距的,这样往往就不会去细看规格书了,所以这次的运气
    wuliangu 2025-01-21 00:15 183浏览
我要评论
0
点击右上角,分享到朋友圈 我知道啦
请使用浏览器分享功能 我知道啦