维康桑格研究所使用NVIDIA加速计算加速癌症研究,同时实现拯救生命与节能

原创 英伟达NVIDIA中国 2024-10-28 17:20

总部位于英国的维康桑格研究所的 DNA 测序实验室每年分析数以万计的基因组,为癌症的形成和治疗效果提供洞察。


*主图由维康桑格研究所提供


维康桑格研究所是国际人类基因组计划的重要贡献者,该研究所正在使用 NVIDIA 加速计算技术来节省能源,同时挽救生命。


作为全球最大的基因测序机构之一,这家位于英国的研究所已读取了超过 48 个 Petabase(或 48 千万亿个碱基对)的 DNA 和 RNA 序列,以提炼有关健康和疾病的关键洞察。


为了研究引发癌症形成的突变过程以及决定治疗效果的基因变异,该研究所的癌症、衰老和体细胞突变(CASM)项目每年对数万个癌症基因组进行测序和分析。


为了如此大规模研究的顺利进行,维康桑格研究所正在尝试使用具备 NVIDIA Parabricks 的 NVIDIA 系统。NVIDIA Parabricks 是一个可扩展的基因组学分析软件套件,它利用加速计算,将数据处理时间缩短至几分钟。


维康桑格研究所 CASM 主要软件开发人员 Jingwei Wang 表示:“维康桑格研究所每年要处理数十万份体细胞样本。NVIDIA 加速计算和 Parabricks 将为我们的样本分析工作节省大量时间、成本和能源。我们十分高兴能够借助 NVIDIA Grace、Grace Hopper 等 NVIDIA 的先进架构来提高性能和效率。”


减少运行时间和能耗


维康桑格研究所致力于开发高通量癌症样本模型,这些模型可用于全基因组功能筛选和药物测试。


NVIDIA 加速计算和软件大大减少了该研究所每个基因组的分析运行时间和能耗。


为了使用 Burrows-Wheeler Aligner(BWA,一个用于根据大型参考基因组绘制 DNA 序列的软件包)加速基因组分析,维康桑格研究所使用了其在 CPU 上运行的自主工作流 CaVEMan,并且正在尝试利用 NVIDIA GPU 上的 Parabricks。


该研究所使用一个 NVIDIA 系统,和使用 128 台双路 CPU 服务器时相比,就将运行时间缩短 37.5%,成本和能耗也将分别减少 96% 和 98%。


该研究所每年每测序 1 万个基因组,就要消耗约 1.25 亿个 CPU 小时。


这意味着,维康桑格研究所如果改为通过 GPU 上的 Parabricks 使用 BWA,每年可节省 100 万美元和 1000 兆瓦时的电,这相当于一个美国普通家庭 100 年的用电量。


与行业领先者合作


维康桑格研究所的 NVIDIA 加速测序实验室可谓是一个 AI 工厂。只要给它输入数据,就能生产出智能。


AI 工厂是拥有先进全栈加速计算平台的下一代数据中心,可执行最密集的计算任务。


在研究对于发现新癌症基因和突变过程至关重要的科学问题时,维康桑格研究所正在通过将 NVIDIA 基础设施用于其 AI 工厂,来提高运营和能源效率。


另外,建造 AI 工厂的企业和组织正在与能源管理和自动化公司施耐德电气等领先企业开展跨行业合作,通过优化数据中心的设计,以最节能的方式运行苛刻的工作负载。


维康桑格研究所正在与施耐德电气一起,尽可能减少数据中心的停机时间,同时为 DNA 测序实验室的数据中心配备不间断电源和冷却设备,以及其他关键的节能技术。


在今年 3 月举行的 NVIDIA GTC 大会上,施耐德电气宣布将发布专为 NVIDIA 加速计算集群定制的 AI 数据中心参考设计,以帮助各个行业的企业机构优化基础设施。


这些参考设计专门用于数据处理、工程仿真、电子设计自动化、计算机辅助药物设计和生成式 AI,将侧重于可扩展、可持续、高性能数据中心的大功率配电、液冷系统等方面。


在由《经济学人》杂志主办的纽约气候周专题讨论会上,来自维康桑格研究所、施耐德电气和 NVIDIA 的代表将介绍他们的工作。


进一步了解有关可持续计算威康桑格研究所可能挽救生命的工作


  • https://www.nvidia.cn/data-center/sustainable-computing/


  • https://resources.nvidia.com/en-us-energy-efficiency/gen-ai-for-finding-cancer-faster?ncid=prsy-503733-vt12



点击“阅读原文”,或扫描下方海报二维码,观看 NVIDIA 创始人兼首席执行官黄仁勋与信实工业董事长穆克什·安巴尼在 NVIDIA AI Summit India 上就 AI 未来进行的炉边谈话回放。


评论
  • 最近几年,新能源汽车愈发受到消费者的青睐,其销量也是一路走高。据中汽协公布的数据显示,2024年10月,新能源汽车产销分别完成146.3万辆和143万辆,同比分别增长48%和49.6%。而结合各家新能源车企所公布的销量数据来看,比亚迪再度夺得了销冠宝座,其10月新能源汽车销量达到了502657辆,同比增长66.53%。众所周知,比亚迪是新能源汽车领域的重要参与者,其一举一动向来为外界所关注。日前,比亚迪汽车旗下品牌方程豹汽车推出了新车方程豹豹8,该款车型一上市就迅速吸引了消费者的目光,成为SUV
    刘旷 2024-12-02 09:32 119浏览
  • 戴上XR眼镜去“追龙”是种什么体验?2024年11月30日,由上海自然博物馆(上海科技馆分馆)与三湘印象联合出品、三湘印象旗下观印象艺术发展有限公司(下简称“观印象”)承制的《又见恐龙》XR嘉年华在上海自然博物馆重磅开幕。该体验项目将于12月1日正式对公众开放,持续至2025年3月30日。双向奔赴,恐龙IP撞上元宇宙不久前,上海市经济和信息化委员会等部门联合印发了《上海市超高清视听产业发展行动方案》,特别提到“支持博物馆、主题乐园等场所推动超高清视听技术应用,丰富线下文旅消费体验”。作为上海自然
    电子与消费 2024-11-30 22:03 98浏览
  • 遇到部分串口工具不支持1500000波特率,这时候就需要进行修改,本文以触觉智能RK3562开发板修改系统波特率为115200为例,介绍瑞芯微方案主板Linux修改系统串口波特率教程。温馨提示:瑞芯微方案主板/开发板串口波特率只支持115200或1500000。修改Loader打印波特率查看对应芯片的MINIALL.ini确定要修改的bin文件#查看对应芯片的MINIALL.ini cat rkbin/RKBOOT/RK3562MINIALL.ini修改uart baudrate参数修改以下目
    Industio_触觉智能 2024-12-03 11:28 84浏览
  • 作为优秀工程师的你,已身经百战、阅板无数!请先醒醒,新的项目来了,这是一个既要、又要、还要的产品需求,ARM核心板中一个处理器怎么能实现这么丰富的外围接口?踌躇之际,你偶阅此文。于是,“潘多拉”的魔盒打开了!没错,USB资源就是你打开新世界得钥匙,它能做哪些扩展呢?1.1  USB扩网口通用ARM处理器大多带两路网口,如果项目中有多路网路接口的需求,一般会选择在主板外部加交换机/路由器。当然,出于成本考虑,也可以将Switch芯片集成到ARM核心板或底板上,如KSZ9897、
    万象奥科 2024-12-03 10:24 68浏览
  • 概述 说明(三)探讨的是比较器一般带有滞回(Hysteresis)功能,为了解决输入信号转换速率不够的问题。前文还提到,即便使能滞回(Hysteresis)功能,还是无法解决SiPM读出测试系统需要解决的问题。本文在说明(三)的基础上,继续探讨为SiPM读出测试系统寻求合适的模拟脉冲检出方案。前四代SiPM使用的高速比较器指标缺陷 由于前端模拟信号属于典型的指数脉冲,所以下降沿转换速率(Slew Rate)过慢,导致比较器检出出现不必要的问题。尽管比较器可以使能滞回(Hysteresis)模块功
    coyoo 2024-12-03 12:20 108浏览
  •         温度传感器的精度受哪些因素影响,要先看所用的温度传感器输出哪种信号,不同信号输出的温度传感器影响精度的因素也不同。        现在常用的温度传感器输出信号有以下几种:电阻信号、电流信号、电压信号、数字信号等。以输出电阻信号的温度传感器为例,还细分为正温度系数温度传感器和负温度系数温度传感器,常用的铂电阻PT100/1000温度传感器就是正温度系数,就是说随着温度的升高,输出的电阻值会增大。对于输出
    锦正茂科技 2024-12-03 11:50 106浏览
  • 当前,智能汽车产业迎来重大变局,随着人工智能、5G、大数据等新一代信息技术的迅猛发展,智能网联汽车正呈现强劲发展势头。11月26日,在2024紫光展锐全球合作伙伴大会汽车电子生态论坛上,紫光展锐与上汽海外出行联合发布搭载紫光展锐A7870的上汽海外MG量产车型,并发布A7710系列UWB数字钥匙解决方案平台,可应用于数字钥匙、活体检测、脚踢雷达、自动泊车等多种智能汽车场景。 联合发布量产车型,推动汽车智能化出海紫光展锐与上汽海外出行达成战略合作,联合发布搭载紫光展锐A7870的量产车型
    紫光展锐 2024-12-03 11:38 101浏览
  • 11-29学习笔记11-29学习笔记习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习笔记&记录学习习笔记&记学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&学习学习笔记&记录学习学习笔记&记录学习学习笔记&记
    youyeye 2024-12-02 23:58 71浏览
  • TOF多区传感器: ND06   ND06是一款微型多区高集成度ToF测距传感器,其支持24个区域(6 x 4)同步测距,测距范围远达5m,具有测距范围广、精度高、测距稳定等特点。适用于投影仪的无感自动对焦和梯形校正、AIoT、手势识别、智能面板和智能灯具等多种场景。                 如果用ND06进行手势识别,只需要经过三个步骤: 第一步&
    esad0 2024-12-04 11:20 50浏览
  • 光伏逆变器是一种高效的能量转换设备,它能够将光伏太阳能板(PV)产生的不稳定的直流电压转换成与市电频率同步的交流电。这种转换后的电能不仅可以回馈至商用输电网络,还能供独立电网系统使用。光伏逆变器在商业光伏储能电站和家庭独立储能系统等应用领域中得到了广泛的应用。光耦合器,以其高速信号传输、出色的共模抑制比以及单向信号传输和光电隔离的特性,在光伏逆变器中扮演着至关重要的角色。它确保了系统的安全隔离、干扰的有效隔离以及通信信号的精准传输。光耦合器的使用不仅提高了系统的稳定性和安全性,而且由于其低功耗的
    晶台光耦 2024-12-02 10:40 120浏览
  • RDDI-DAP错误通常与调试接口相关,特别是在使用CMSIS-DAP协议进行嵌入式系统开发时。以下是一些可能的原因和解决方法: 1. 硬件连接问题:     检查调试器(如ST-Link)与目标板之间的连接是否牢固。     确保所有必要的引脚都已正确连接,没有松动或短路。 2. 电源问题:     确保目标板和调试器都有足够的电源供应。     检查电源电压是否符合目标板的规格要求。 3. 固件问题: &n
    丙丁先生 2024-12-01 17:37 100浏览
  • 《高速PCB设计经验规则应用实践》+PCB绘制学习与验证读书首先看目录,我感兴趣的是这一节;作者在书中列举了一条经典规则,然后进行详细分析,通过公式推导图表列举说明了传统的这一规则是受到电容加工特点影响的,在使用了MLCC陶瓷电容后这一条规则已经不再实用了。图书还列举了高速PCB设计需要的专业工具和仿真软件,当然由于篇幅所限,只是介绍了一点点设计步骤;我最感兴趣的部分还是元件布局的经验规则,在这里列举如下:在这里,演示一下,我根据书本知识进行电机驱动的布局:这也算知行合一吧。对于布局书中有一句:
    wuyu2009 2024-11-30 20:30 122浏览
我要评论
0
点击右上角,分享到朋友圈 我知道啦
请使用浏览器分享功能 我知道啦