分析丨基因组数据太多了,存储怎么办?

原创 AI芯天下 2022-08-12 20:30

·聚焦:人工智能、芯片等行业

欢迎各位客官关注、转发






前言

DNA存储了恐龙的生物信息,科技让它重新表达。DNA存储或许也可以像我们如今用的移动硬盘一样进行现场即时存储。


DNA存储技术将有望成为下一代信息存储技术。


作者 | 方文
图片来源 |  网 络 


 

DNA数据保存面临“大”问题


在大自然里,DNA负责存储遗传信息。

单个人体细胞的平均直径是5到200微米,这其中的DNA可以包含一个人全部的遗传信息:30亿对碱基。

大规模的基因组测序正在进行,随之产生的数据规模快速增长。

存储、压缩这些数据是个麻烦事,现有的技术方案看起来不太行。

据估计:人类基因组需要高达2-40EB的存储容量。

这可能超过一个世界级科技公司的云存储量,全世界苹果用户存储在谷歌云上的数据总量大约是8EB。

这8EB数据,每月存储费需要2.18亿美元。




DNA存储原理其实很难理解


DNA由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)4个碱基构成双螺旋结构,可以保存生物体的遗传信息。


DNA存储遗传信息的原理并不复杂,它由四种核苷酸A、T、G、C组成,彼此两两对应,组成双螺旋结构。


在数字世界,所有的信息本质上是0和1组成的数据串。


想要DNA存储数字信息,简单理解,原就是将0和1的编码序列转换成核苷酸的序列。


DNA存储的优势在于密度大,大约在你眼前逗号这么大小,1立方毫米的DNA,就可以容纳9TB(1TB=1024GB)的信息。


在自然界存在的DNA中,A和T,C与G两两配对,在一条DNA中,CG与AT的存在比例基本均匀,为50%左右。


也就是说,虽然DNA的存储能力很强,但它们不得不以很多条短链的方式存在。



难以突破的结构性障碍


虽然DNA存储具有较为明显突出的优势,政策、资本等也在全方位的支持,应用的前景广阔,但商业化的进展仍然十分缓慢。


其最大屏障来自于其存储技术本身。


DNA存储数据的过程主要分为五个步骤:


①编码——将数字信息编码为DNA序列;


②合成——将序列融入实际的DNA分子;


③存储——将合成的DNA片段保存在载体或细胞中;


④访问——检索和选择性读取序列信息;


⑤解码——将测定的序列信息转换回数字信息。


在整个存储的过程中,编码与合成是DNA存储中较为关键和困难的环节。


总的来说,DNA存储的各个环节都有较多的难关需要克服,DNA存储真正意义上的走入商业市场。



DNA存储试图走向商业化道路


2020年微软、西部数据和基因测序巨头Illumina、DNA合成初创公司TwistBioscience等联合成立了DNA数据存储联盟。


这是世界上第一个该领域的学术和产业链联盟,这个联盟希望制定技术和格式标准,最终建立一个可以通用的商业系统。


微软研究院在2015年就成立了DNA存储的项目,2021年微软开发出首个纳米级DNA存储器,能够在每个平方厘米的区域上,同时合成25X106(2650)条碱基序列。


这个新的技术把原来同时合成碱基序列的数字从个位提升到了千位。这个吞吐量,让DNA合成速度变成了每秒兆字节(MB)。


进一步发展成为主流的存储设备,还需要长时间的沉淀,才能让DNA存储技术有实质的进阶。


DNA存储在AI技术的加持下,其编码的环节效率也获得了极大地提升。


未来随着纳米技术与AI技术的加持,DNA存储的技术也会一步步解除智识的限制禁锢,逐步升级,为存储领域带来质的飞跃。



DNA存储的四大优势


相比于目前我们常用的存储介质,如U盘、光盘、硬盘等,DNA存储具有一系列优势。


①存储密度高。每立方厘米的DNA分子可以存储大约1EB的信息,这一密度是当前存储密度最高的介质(闪存)的1000倍,是硬盘数据存储密度的百万倍。


②保存寿命长。从理论上来说,DNA数据在没有特别人工干预的情况下至少能保存千年之久。


③维护成本低。存储在DNA的数据,理论上来说通过低温冷冻或者固态封存的手段,可以长时间存储且几乎不需要维护。


④DNA存储所需要的占地也远小于传统存储介质,并且还具备数据易复制、易携带、能在生物体内存储等特点。



现阶段至少需要解决的三大问题


①读写速度太慢:以目前的技术在合成DNA时,每添加一个碱基大约需要0.1秒钟时间。保存一首高音质的MP3歌曲都需要差不多1个月时间。


②成本太高:目前合成2MB的DNA数据需要7000美元,读取数据需要2000美元,如果以DNA形式存储1GB大小的电影,编码大约需要花费358万美元。


③合成DNA的稳定性:合成DNA过程中产生的错误率对于要求确保100%真实性和完整性的数据存储指标而言是致命的问题。




结尾:

但这项技术目前远未成熟,或许离真正商用还需要20年,甚至更长。


或许有可能过程中碰到一个难以突破的技术瓶颈导致中途夭折;或许过程中出现另外一项更具革命性的存储技术,比如量子存储,形成降维打击。


部分资料参考:极客公园:《你身体里的DNA,能存下整个宇宙的数据》,脑极体:《存储新图谱:DNA存储的边界与天地》


本公众号所刊发稿件及图片来源于网络,仅用于交流使用,如有侵权请联系回复,我们收到信息后会在24小时内处理。



END


推荐阅读:


商务合作请加微信勾搭:

18948782064

请务必注明:

「姓名 + 公司 + 合作需求」


AI芯天下 聚焦人工智能,AI芯片,5G通讯等行业动态
评论
  • 彼得·德鲁克被誉为“现代管理学之父”,他的管理思想影响了无数企业和管理者。然而,关于他的书籍分类,一种流行的说法令人感到困惑:德鲁克一生写了39本书,其中15本是关于管理的,而其中“专门写工商企业或为企业管理者写的”只有两本——《为成果而管理》和《创新与企业家精神》。这样的表述广为流传,但深入探讨后却发现并不完全准确。让我们一起重新审视这一说法,解析其中的矛盾与根源,进而重新认识德鲁克的管理思想及其著作的真正价值。从《创新与企业家精神》看德鲁克的视角《创新与企业家精神》通常被认为是一本专为企业管
    优思学院 2025-01-06 12:03 161浏览
  • 这篇内容主要讨论三个基本问题,硅电容是什么,为什么要使用硅电容,如何正确使用硅电容?1.  硅电容是什么首先我们需要了解电容是什么?物理学上电容的概念指的是给定电位差下自由电荷的储藏量,记为C,单位是F,指的是容纳电荷的能力,C=εS/d=ε0εrS/4πkd(真空)=Q/U。百度百科上电容器的概念指的是两个相互靠近的导体,中间夹一层不导电的绝缘介质。通过观察电容本身的定义公式中可以看到,在各个变量中比较能够改变的就是εr,S和d,也就是介质的介电常数,金属板有效相对面积以及距离。当前
    知白 2025-01-06 12:04 227浏览
  • 大模型的赋能是指利用大型机器学习模型(如深度学习模型)来增强或改进各种应用和服务。这种技术在许多领域都显示出了巨大的潜力,包括但不限于以下几个方面: 1. 企业服务:大模型可以用于构建智能客服系统、知识库问答系统等,提升企业的服务质量和运营效率。 2. 教育服务:在教育领域,大模型被应用于个性化学习、智能辅导、作业批改等,帮助教师减轻工作负担,提高教学质量。 3. 工业智能化:大模型有助于解决工业领域的复杂性和不确定性问题,尽管在认知能力方面尚未完全具备专家级的复杂决策能力。 4. 消费
    丙丁先生 2025-01-07 09:25 122浏览
  • 村田是目前全球量产硅电容的领先企业,其在2016年收购了法国IPDiA头部硅电容器公司,并于2023年6月宣布投资约100亿日元将硅电容产能提升两倍。以下内容主要来自村田官网信息整理,村田高密度硅电容器采用半导体MOS工艺开发,并使用3D结构来大幅增加电极表面,因此在给定的占位面积内增加了静电容量。村田的硅技术以嵌入非结晶基板的单片结构为基础(单层MIM和多层MIM—MIM是指金属 / 绝缘体/ 金属) 村田硅电容采用先进3D拓扑结构在100um内,使开发的有效静电容量面积相当于80个
    知白 2025-01-07 15:02 145浏览
  • 每日可见的315MHz和433MHz遥控模块,你能分清楚吗?众所周知,一套遥控设备主要由发射部分和接收部分组成,发射器可以将控制者的控制按键经过编码,调制到射频信号上面,然后经天线发射出无线信号。而接收器是将天线接收到的无线信号进行解码,从而得到与控制按键相对应的信号,然后再去控制相应的设备工作。当前,常见的遥控设备主要分为红外遥控与无线电遥控两大类,其主要区别为所采用的载波频率及其应用场景不一致。红外遥控设备所采用的射频信号频率一般为38kHz,通常应用在电视、投影仪等设备中;而无线电遥控设备
    华普微HOPERF 2025-01-06 15:29 172浏览
  •  在全球能源结构加速向清洁、可再生方向转型的今天,风力发电作为一种绿色能源,已成为各国新能源发展的重要组成部分。然而,风力发电系统在复杂的环境中长时间运行,对系统的安全性、稳定性和抗干扰能力提出了极高要求。光耦(光电耦合器)作为一种电气隔离与信号传输器件,凭借其优秀的隔离保护性能和信号传输能力,已成为风力发电系统中不可或缺的关键组件。 风力发电系统对隔离与控制的需求风力发电系统中,包括发电机、变流器、变压器和控制系统等多个部分,通常工作在高压、大功率的环境中。光耦在这里扮演了
    晶台光耦 2025-01-08 16:03 75浏览
  • 根据环洋市场咨询(Global Info Research)项目团队最新调研,预计2030年全球无人机锂电池产值达到2457百万美元,2024-2030年期间年复合增长率CAGR为9.6%。 无人机锂电池是无人机动力系统中存储并释放能量的部分。无人机使用的动力电池,大多数是锂聚合物电池,相较其他电池,锂聚合物电池具有较高的能量密度,较长寿命,同时也具有良好的放电特性和安全性。 全球无人机锂电池核心厂商有宁德新能源科技、欣旺达、鹏辉能源、深圳格瑞普和EaglePicher等,前五大厂商占有全球
    GIRtina 2025-01-07 11:02 127浏览
  • 本文介绍编译Android13 ROOT权限固件的方法,触觉智能RK3562开发板演示,搭载4核A53处理器,主频高达2.0GHz;内置独立1Tops算力NPU,可应用于物联网网关、平板电脑、智能家居、教育电子、工业显示与控制等行业。关闭selinux修改此文件("+"号为修改内容)device/rockchip/common/BoardConfig.mkBOARD_BOOT_HEADER_VERSION ?= 2BOARD_MKBOOTIMG_ARGS :=BOARD_PREBUILT_DTB
    Industio_触觉智能 2025-01-08 00:06 100浏览
  • 「他明明跟我同梯进来,为什么就是升得比我快?」许多人都有这样的疑问:明明就战绩也不比隔壁同事差,升迁之路却比别人苦。其实,之间的差异就在于「领导力」。並非必须当管理者才需要「领导力」,而是散发领导力特质的人,才更容易被晓明。许多领导力和特质,都可以通过努力和学习获得,因此就算不是天生的领导者,也能成为一个具备领导魅力的人,进而被老板看见,向你伸出升迁的橘子枝。领导力是什么?领导力是一种能力或特质,甚至可以说是一种「影响力」。好的领导者通常具备影响和鼓励他人的能力,并导引他们朝着共同的目标和愿景前
    优思学院 2025-01-08 14:54 80浏览
  • By Toradex 秦海1). 简介嵌入式平台设备基于Yocto Linux 在开发后期量产前期,为了安全以及提高启动速度等考虑,希望将 ARM 处理器平台的 Debug Console 输出关闭,本文就基于 NXP i.MX8MP ARM 处理器平台来演示相关流程。 本文所示例的平台来自于 Toradex Verdin i.MX8MP 嵌入式平台。  2. 准备a). Verdin i.MX8MP ARM核心版配合Dahlia载板并
    hai.qin_651820742 2025-01-07 14:52 113浏览
  • 在智能家居领域中,Wi-Fi、蓝牙、Zigbee、Thread与Z-Wave等无线通信协议是构建短距物联局域网的关键手段,它们常在实际应用中交叉运用,以满足智能家居生态系统多样化的功能需求。然而,这些协议之间并未遵循统一的互通标准,缺乏直接的互操作性,在进行组网时需要引入额外的网关作为“翻译桥梁”,极大地增加了系统的复杂性。 同时,Apple HomeKit、SamSung SmartThings、Amazon Alexa、Google Home等主流智能家居平台为了提升市占率与消费者
    华普微HOPERF 2025-01-06 17:23 211浏览
  • 故障现象一辆2017款东风风神AX7车,搭载DFMA14T发动机,累计行驶里程约为13.7万km。该车冷起动后怠速运转正常,热机后怠速运转不稳,组合仪表上的发动机转速表指针上下轻微抖动。 故障诊断 用故障检测仪检测,发动机控制单元中无故障代码存储;读取发动机数据流,发现进气歧管绝对压力波动明显,有时能达到69 kPa,明显偏高,推断可能的原因有:进气系统漏气;进气歧管绝对压力传感器信号失真;发动机机械故障。首先从节气门处打烟雾,没有发现进气管周围有漏气的地方;接着拔下进气管上的两个真空
    虹科Pico汽车示波器 2025-01-08 16:51 86浏览
我要评论
0
点击右上角,分享到朋友圈 我知道啦
请使用浏览器分享功能 我知道啦